ошибки скорее всего возникают из папки dev ибо там находятся подключенные устройства, которые просто представлены файлами, но их нельзя копировать!
может быть есть подобные файлы и в других папках так что их вообще не надо копировать.
А вообще лучше поинтересоваться в каких именно папках лежат все нужные проги, конфиги и библиотеки и скопировать именно их, чтобы потом не было проблем.