>Система, по моиму мнению использует дополнительное пространство диска для подкачки
Система использует для подкачки отдельный раздел. На разделе с файловой системой свопа нет.
Да, нужно посмотреть содержимое, там явно что-то не так.
Ну и удалить, конечно, можно, это же лог.