Чем можно забить корневой раздел в 50 гигов, если вся репа весит порядка 30 гигов?
Если на этом же разделе хранится всякое видео/музыка может проще это перенести на другой раздел?
Если резать корневой раздел, то грузись с лайфцд, увеличивай раздел, записывай в /etc/fstab новый uuid раздела и наверное обнови grub.