Нет, галка изначально была снята. Только что специально поставил ее, начал новый сеанс, потом отключил - никакой разницы. А есть другие способы это исправить, кроме твика? Хоть я особо не лазил нигде, но мало ли...
Хм... Только что залез в твик, вкладку Личные-Шаблоны. Было сообщение что путь к ним указан неверно, просто восстановил дефолтные настройки, а в Папках на некоторых был указан путь просто в домашнюю, Загрузки например. Указал путь куда нужно и как ни странно но все с рабочего стола исчезло и стало как надо... Чего это я такое сделал:)
но проблема с вылезающим окном при открытии папок через главное меню по-прежнему актуальна.