грохнуть-то можно, только зачем? так уж мешает?
/opt у меня пустой, а вот в /mnt частенько что-нибудь монтирую. плюс, например, в том, что в /mnt наутилус не лезет - соответственно, не будет сие висеть где ни попадя. и смонтированный в mnt диск быстрее найти, чем в /media/что-то-еще - букаф меньше))