А как ставил пакеты, через синаптик, apt-get или ручками (через dpkg) ?
Это я к чему... Для 10.04 у меня есть пакет php5-sqlite а пакета php5-sqlite3 нет. От куда ты его взял?
Кроме того если траблы с зависимостями, то dpkg позволяет отключить проверку зависимостей при установке пакета(ов).
Но все-таки, как ставил?