Вы что не пережимаете звук?!
Без этого в 75% случаях будут проблемы!
Я в mp3 или aac пережимаю, так как всегда только 2-а канала оставляю.
mp4 как контейнер не люблю имхо =/
Когда я пережимала в mp3, отставание осталось, в aac тоже... Попробовала еще ac3 (лишь бы проверить) - результат отрицательный
Я теперь тоже его не люблю, но а что поделать? Я выкладываю видео вконтакт, а там mkv не поддерживается, avi выходит после пережатия с искажениями. FLV не могу сделать, потому что изначально mp4. Другие не пробовала, потому что не знаю, чем они отличаются и который лучше.