Возможно с тем, что в Ubuntu криво реализована система языков. В оффтопике есть точно упоминание как о раскладке клавиатуры, так и о языке ввода (в настройках, я имею в виду). То, что мы переключаем в оффтопике по Alt+Shift и тому подобным сочетаниям -- это язык ввода. Что происходит в оффтопике при смене раскладки, я не знаю. Сколько ни пытался, никакого влияния на вводимый мной текст это не оказало.
В Ubuntu, наверное, все по-другому.