Если не касаться kXNeur, то могу сообщить, что XNeur и gXNeur научились воспринимать любое сочетание клавиш как свой шоткат. Можно использовать Shift, Control, Alt, Super + любую клавишу.
Появились шоткаты для включения определенной раскладки. Например, Ctrl+q - английский, Ctrl+w - русский.
xneurrc сменился, если будете обновляться из svn, будьте внимательны.
kXneur из svn уже не совместим с новым xneur.