Насколько я помню, Systemback умеет восстанавливать бекапы на любой раздел. В LiveCD-USB Ubuntu загружаешься, ставишь Systemback и пробуешь.
Так же вроде есть консольный вариант Systemback, который через chroot сработает, я думаю, но это уже сложнее будет.