Во-первых, не надо пользоваться "Менеджером приложений" (оно же "Центр приложений") вообще совсем никогда. Он и из родного репозитория приложения видит через раз. Для этого есть Synaptic. Установите и радуйтесь.
Во-вторых, в Ubuntu система пакетов DEB и соответственно, менеджер пакетов DPKG. Надстройка над ним APT. Остальные приблуды типа упомянутых выше, варианты GUI (графический интерфейс пользователя) к нему.
В-третьих, APT работает с репозиториями, указанными в списке (/etc/apt/mirror.list). Соответственно, он знает о пакетах, которые есть в репозитории и ничего не знает о пакетах, которых там нет.
В-четвёртых, достаточно левой мышью жмакнуть по ссылке на пакет и он волшебным образом установится:

В-пятых, никто не мешает установить пакет, просто скачанный на диск. Для этого нужно всего лишь указать на него: дать полный путь к пакету или запустить APT в том каталоге, где он находится. Предположим, что пакет "package.deb" скачан в домашний каталог пользователя "user". Тогда:
sudo apt-get install /home/user/ packgage.deb
Или, соответственно,
cd /home/user
sudo apt-get instal packgage.deb
______________
Поправил ваше изображение - рекомендовано использовать сервис itmages.ru - нет рекламы, превью не в полный размер, https.
~Punko