Была такая проблема. По-умолчанию пароль для рута в системе не стоит (т.е. пустой), и в recovery mode под рута можно входить без пароля (кстати по сути серьёзная дыра, по моему мнению... если не ставить пароль на grub). На практике passwd там помогает на 100%, так что проблем быть не должно. И советую там же поставить пароль на рута тем же passwd root <пароль>, ибо действительно как-то по-идиотски... (зы. но автора это не касается))