Просто пользователь, была похожая канитель буквально на днях.
Ставил дочке 14-й бубен на бук.
Всё установилось, (загрузчик конечно же установлен на /dev/sda) вынул флэху/ребут и всё, ругань на отсутствие загрузочного сектора.
В бивис не мог войти, как до этого, сразу выпадала ошибка загрузки, пока флэху обратно не засунул и не ребутнулся.
Только после этого смог войти в BIOS.
С чем именно связанно такое дикое поведение, пока так и не понял. Никогда с такого рода проблемами ранее не встречался.
После того, как вошёл, сделал Restore Defaults >> F10 >> Reboot
Пошла загрузка через GRUB с выбором осей.
Но, - это мой случай.
Возможно, нужно также BIOS обновить.